No duodeno, ocorre uma etapa crucial da digestão química. Aqui, várias secreções desempenham papéis importantes. A bile, produzida no fígado e armazenada na vesícula biliar, é liberada no duodeno para emulsificar as gorduras, quebrando-as em pequenas partículas que podem ser digeridas pelas enzimas lipases pancreáticas. Além disso, o pâncreas secreta enzimas digestivas, incluindo lipase, amilase e tripsina, que ajudam a quebrar proteínas, gorduras e carboidratos. O próprio duodeno também secreta mucosa, que atua na proteção da mucosa intestinal e no equilíbrio do pH para otimizar a atividade das enzimas. Essas secreções em conjunto permitem a quebra eficiente dos alimentos para absorção no intestino delgado.