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Os sintomas da peste bubônica geralmente surgem 2 a 5 dias após a exposição à bactéria, mas podem ocorrer de algumas horas a 12 dias mais tarde. Iniciam abruptamente com calafrios e uma febre de até 41°C. Os batimentos cardíacos tornam-se rápidos e fracos e a pressão arterial pode cair. As ínguas aparecem ao mesmo tempo ou logo após a febre e em geral é dolorosa à palpação.
A peste causada pela infecção por Yersinia pestis pode ser bubônica, pneumônica, septicêmica ou pestis minor, e os sintomas variam de acordo com o tipo de peste.
Pode ocorrrer agitação, delírio, confusão mental e perda da coordenação motora. O fígado e o baço podem aumentar de volume.
Mais de metade dos indivíduos não tratados morrem entre o terceiro e o quinto dia após o início dos sintomas.